本所下设办公室、研究室、辐照中心三个部门。

一、办公室主要职责
1、协助领导抓好督促检查与业绩考评工作；
2、负责文书、印章、证件、办公用品等使用和管理工作
3、负责文秘与组织协调工作；
4、协助领导做好对外宣传与内、外接待工作；
5、抓好环境、安全、后勤等管理工作。

二、研究室主要职责
1、开展辐射诱变育种与低剂量刺激农作物生长技术研究。
2、开展辐照加工及其标准化体系研究。
3、开展农副产品辐照贮藏保鲜技术研究。
4、开展食品农药残留和生活有毒废弃物的辐照脱毒与降解研究。

三、辐照中心主要职责
1、进行辐照加工工艺试验；
2、进行辐射诱变育种工艺试验；
3、进行辐照灭菌工艺研究及其产业化应用；
4、进行辐射应用技术咨询等服务。