江西省农业应用微生物研究所（原江西省农科所菌种站）成立于1971年，是当时全国早期开展食用菌研究的主要科研机构之一。1995年经江西省人民政府批准更名为江西省农科院农业应用微生物研究所，属国有事业单位。

一、职工人数：

现有职工34人，其中高级职称9人，中级职称6人，享受国家政府特殊津贴 1人。

二、机构设置：

办公室、食用菌研究室、微生物实验室、农业部食用菌实验厂。

三、资产：

本所拥有一栋2200平方米的科研实验大楼，固定资产总值500余万元。

四、科学研究：

本所自成立以来，主要开展的研究有：1、香菇、平菇、双孢蘑菇、金针菇、黑木耳的人工代料栽培及高产栽培研究；2、灵芝、猴头菌等药用真菌的栽培及加工研究；3、杏鲍菇、白灵菇、鲍鱼菇、真姬菇、滑菇、黄伞、大杯伞、榆黄蘑、金福菇、大球盖菇、虫草、羊肚菌等珍稀品种高产栽培及人工驯化栽培研究；4、国内外优良品种的引进与示范推广研究；5、食用菌病虫害防治研究；6、生物固氮菌、生物肥料的研究；动物饲料添加剂（酵母菌、黑曲霉）研究。近年来承担各类科研项目50多项，获省、部级各类奖项20余项，出版各类科技著作10余部，在各类期刊发表论文100多篇。

五、科技开发

长期以来，本所坚持以用“科技服务于农业、促进农村经济发展”为宗旨，发挥自身优势，将食用菌生产技术普及全省乃至全国农村纳入所里的中心工作之一。先后举办各种食用菌高产栽培培训班，累计培训人员2万余人；技术咨询上万人次；技术指导、技术服务上千次。先后在南昌、靖安、奉新、贵溪、丰城、武宁、进贤、黎川、德兴等县市，建立生产示范基地，指导和带动当地食用菌的生产。1987年本所创办了江西省食用菌菌种厂，以菌种为依托，每年向广大菇农提供4-5万瓶优良菌种和食用菌生产所需原材料，菌种厂的推广工作和取得的成绩得到了江西省农业厅和国家农业部的普遍高度重视，1991年经国家农业部批准挂牌为农业部江西省食用菌菌种厂。

在省委、省政府“服务三农”的号召下，本所加大开发力度与武宁绿色产业中心合作，建立了武宁县灵芝示范生产基地，走出了一条公司+农户，科工贸一条龙的产业化道路，农户种植灵芝每年每亩获利万元。此外，本所依靠自身科技优势，建立了虫草生产车间；依托武宁生态条件，建立了仿野生灵芝种植基地。开发的科技产品有破壁灵芝孢子粉、灵芝、虫草、珍稀食用菌等四个系列产品。